简单INDEL编码与其它空位编码方法的比较

编号 zgly0000471899

文献类型 期刊论文

文献题名 简单INDEL编码与其它空位编码方法的比较

学科分类 220.3020;森林昆虫学

作者 史卫峰  黄大卫  沈佐锐 

作者单位 中国农业大学昆虫学系IPMist实验室  中国科学院动物研究所  山东农业大学植物保护学院 

母体文献 动物分类学报 

年卷期 2006,31(1)

页码 88-94

年份 2006 

分类号 Q966 

关键词 空位  简单indel编码  丢失的数据  第5性状  系统发育分析. 

文摘内容 不同的系统发育重建算法以不同的方式编码空位,但是不同的编码方式对系统发育分析结果的影响并不清楚。介绍了一种新的空位编码方式--简单indel编码,并将它与将空位编码成丢失的数据和编码成第5性状作了比较。统计分析表明,简单indel编码的确比将空位编码成丢失的数据更有效,但是与将空位编码成第5性状相比两者结果差异不大。而且,随着空位含量的降低,简单indel编码发挥的作用也减少。