草菇耐低温突变菌株Vtlt-1和原始菌株V23转录组差异的研究

编号 zgly0001497189

文献类型 期刊论文

文献题名 草菇耐低温突变菌株Vtlt-1和原始菌株V23转录组差异的研究

作者 吕贝贝  于海龙  祝子坪  蒋玮  何建华  吴潇  李鹏  王金斌  武国干  谭琦  唐雪明 

作者单位 上海市农业科学院生物技术研究所  上海市农业遗传育种重点实验室  上海市农业科学院食用菌研究所  台州学院生命科学学院 

母体文献 菌物学报 

年卷期 2015年06期

年份 2015 

分类号 S646.13 

关键词 草菇  表达谱芯片  耐低温  KEGG代谢通路分析 

文摘内容 为了培育草菇耐低温菌株与解析其耐低温的分子机制,采用紫外诱变的方法,选育出耐低温草菇菌株Vtlt-1,并利用表达谱芯片技术,比较突变菌株Vtlt-1与原始菌株V23的表达差异基因,筛选差异显著基因后利用GO(gene ontology)功能注释和KEGG(kyoto encyclopedia of genes and genomes)通路富集等方法分析,结果发现与V23相比Vtlt-1表达显著差异基因共有1 600个,其中704个基因上调表达,896个基因下调表达。针对差异基因的GO功能分类结果发现:生物学过程方面,差异基因主要分布在金属离子结合、氧化还原过程、碳水化合物的代谢与核酸的结合。细胞组分方面主要与细胞核相关;分子功能中,氧化还原活性以及解旋酶活性,依赖于ATP的解旋酶活性、DNA指导的RNA聚合酶活性。KEGG注释结果发现差异表达基因主要富集在氨基酸与氮类物质的代谢、脂肪酸与生物碱的合成这两方面,此外还富集到核糖体的生物合成、细胞色素P450、RNA聚合酶、硫和氨基酸的代谢、核酸的修复等通路。这些结果为解析草菇耐低温机制提供分子依据和理论基础。