山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较

编号 zgly0000692152

文献类型 期刊论文

文献题名 山核桃SRAP体系的建立及与RAPD和ISSR标记的比较

学科分类 220.45;经济林学

作者 李元春  沈林  曾燕如 

作者单位 浙江农林大学亚热带森林培育同家重点实验室培育基地 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2011,28(3)

页码 505-512

年份 2011 

分类号 S664.1 S718.43 

关键词 经济林学  山核桃  相关序列扩增多态性(SRAP)  随机扩增多态性DNA(RAPD)  简单序列重复区间(ISSR) 

文摘内容 以山核桃Carya cathayensis基因组DNA为模板,对聚合酶链式反应(PCR)体系各组分进行了梯度实验,优化出条带清晰、重复性好的相关序列扩增多态性聚合酶链式反应(SRAP-PCR)扩增体系,并筛选了引物。该体系(25.00μL)为: 1×缓冲液0.20 mmol.L-1,脱氧核糖核苷酸(dNTPs),0.20μmol.L-1引物,2.00 mmol.L-1镁离子(Mg2+),33.34 nkat Taq DNA聚合酶,0.80 mg.L-1基因组DNA(以上均为终浓度)。反应条件为94℃预变性5 min;94℃变性30 s,35℃退火30 s,72℃延伸2 min,5个循环;94℃变性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸2 min,30个循环;72℃延伸8 min,4℃保存,反应时间比其他体系缩短了一半。从100对引物中筛选出了适用于山核桃的引物15对。在山核桃中,随机扩增多态性DNA(RAPD),简单序列重复区间(ISSR),SRAP等3种标记,以SRAP标记每对引物扩增的位点数及每对引物扩增的多态性位点数为多,但SRAP多态性引物的比例、多态性位点比例居于另2种标记之间。在山核桃研究中可以考虑使用SRAP及RAPD标记。图6表4参28