一年生辣椒(Cpsicum annuum L.)与中华辣椒(Cpsicum chinense Jacquin)DNA甲基化多样性分析

编号 zgly0001478490

文献类型 期刊论文

文献题名 一年生辣椒(Cpsicum annuum L.)与中华辣椒(Cpsicum chinense Jacquin)DNA甲基化多样性分析

作者 李涛  徐小万  李颖  李明珠  王恒明  徐晓美  罗少波 

作者单位 广东省农科院蔬菜研究所 

母体文献 分子植物育种 

年卷期 2014年02期

年份 2014 

分类号 S641.3 

关键词 辣椒  表观遗传多样性  DNA甲基化  MSAP 

文摘内容 本研究调查了一年生辣椒和中华辣椒种的DNA甲基化多样性。选取了24个一年生辣椒栽培种和6个中华辣椒栽培种作为研究对象,采用MSAP(methylation-sensitive amplification polymorphism)技术对其基因组CCGG位点的甲基化多样性进行了分析。结果表明,从63对MSAP引物中筛选出5对重复性好、条带清晰的引物对,对30份辣椒种质基因组DNA进行MSAP扩增,得到939条带谱,其中多态性条带937个,多态性比例高达99.79%。DNA甲基化模式分析表明,类型Ⅰ为非甲基化带型(3721),类型Ⅱ为半甲基化带型(3152),类型Ⅲ为全甲基化带型(3839),辣椒甲基化模式主要以全甲基化为主,一年生辣椒(Capsicum annuum L.)和中华辣椒(Capsicum chinense Jacquin)甲基化条带平均分别为319和217,其扩增位点的甲基化率分别77.24%和63.64%,差异达极显著水平。基于相似性系数的UPGMA法聚类分析,在0.68相似水平可以将30个种质分为3个类,第1类:No.10~No.13和No.15共5个种质,其中No.10为一年生辣椒,其它4个为中华辣椒;第2类:No.2~No.9、No.14、No.16~No.30,其中No.14和No.17为中华辣椒;第3类:只有No.1,为一年生辣椒。应用MSAP未能将一年生辣椒和中华辣椒区分开来,表明辣椒表观遗传十分丰富。Nei’s基因多态性指数(h)和Shannon信息指数(I)在2个栽培种中分别为0.204 0和0.329 8、0.186 4和0.297 5,一年生辣椒的表观遗传多样性稍高于中华辣椒。DNA甲基化多样性作为标志遗传多样性的一种信号源,本研究结果为深入探讨辣椒种群分化及物种进化奠定了基础。