朱顶红实时荧光定量PCR中不同组织器官内参基因的筛选

编号 zgly0001633652

文献类型 期刊论文

文献题名 朱顶红实时荧光定量PCR中不同组织器官内参基因的筛选

作者 刘晓婷  王顺利  薛璟祺  薛玉前  吕英民  张秀新 

作者单位 北京林业大学园林学院国家花卉工程技术研究中心  中国农业科学院蔬菜花卉研究所国家花卉改良中心中国农业科学院牡丹研究中心农业部园艺作物生物学与种质创制重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2018年05期

年份 2018 

分类号 S682.25 

关键词 朱顶红  实时荧光定量PCR  内参基因  EF-1α  GAPDH2 

文摘内容 以朱顶红(Hippeastrum vittatum)不同组织器官为试验材料,通过实时荧光定量PCR技术检测肌动蛋白基因(ACT)、亲环蛋白基因(CYP)、转录延伸因子基因(EF-1α)、甘油醛–3–磷酸脱氢酶基因(GAPDH、GAPDH2)、α微管蛋白基因(TUA)和β微管蛋白基因(TUB)这7个常用的看家基因的表达水平,并利用ge Norm、Norm Finder和Best Keeper综合评价其表达稳定性。结果表明,EF-1α和GAPDH2的表达水平较高,而且相对稳定;其次为TUB、TUA和GAPDH。ge Norm和Norm Finder软件分析结果显示,在不同组织器官中CYP和GAPDH2的表达稳定性最高,其次是EF-1α;进一步分析表明,CYP的表达稳定性虽然较高,但是其表达丰度较低,故不适合作为内参基因。Best Keeper分析表明,EF-1α和GAPDH2在不同组织器官中的表达稳定性较好。综合分析表明,EF-1α和GAPDH2在所有样品中表达量较高,稳定性较好。以筛选出来的EF-1α、GAPDH2以及EF-1α+GAPDH2作为内参基因检测朱顶红花器官调控基因PI的表达水平,结果表明,以上述两个基因及其组合为内参基因得到的PI表达模式相同,而且在花器官中的表达高于茎盘和根,基本符合PI调控花模型的机理。因此,EF-1α、GAPDH2或EF-1α+GAPDH2可作为朱顶红的内参基因进行相关基因的表达调控研究。