动态性状功能定位模型的优化

编号 zgly0000476276

文献类型 期刊论文

文献题名 动态性状功能定位模型的优化

学科分类 220.1520;林木遗传学

作者 李嘉涵  杨润清 

作者单位 上海交通大学农业与生物学院 

母体文献 上海交通大学学报: 农业科学版 

年卷期 2006,24(6)

页码 517-523

年份 2006 

分类号 Q943 

关键词 功能定位  均值向量  剩余误差协方差矩阵  子模型  优化 

文摘内容 功能定位的实质是将动态性状变化过程的基本规律镶嵌在QTL定位框架内。拟合与时间相关的QTL基因型的期望均值向量和剩余误差的协方差矩阵是动态性状功能定位的核心内容。根据QTL的统计检测效率, 通过比较关于QTL基因型的期望均值向量和剩余误差的协方差矩阵的子模型的不同组合, 来筛选优化的功能定位模型。以水稻一个DH群体的叶龄性状为例, 我们分别用3个具有生物学意义的子模型和2阶Legendre多项式去拟合QTL基因型的均方向量, 用13个平稳和非平稳模型去描述剩余协方差的变化。其结果GM2和“衰减”指数模型组合被确定为用来检测水稻第3个连锁群控制叶龄动态变化QTL的优化模型。