侵染我国芋的杆状DNA病毒分子鉴定及特异性检测

编号 zgly0001445722

文献类型 期刊论文

文献题名 侵染我国芋的杆状DNA病毒分子鉴定及特异性检测

作者 施世明  王彦芬  王国平  王利平  徐文兴  洪霓 

作者单位 华中农业大学植物科技学院湖北省作物病害监测与安全控制重点实验室  华中农业大学农业微生物学国家重点实验室 

母体文献 植物病理学报 

年卷期 2013年06期

年份 2013 

分类号 S436.32 

关键词 芋  杆状DNA病毒  PCR  序列分析 

文摘内容 采用已报道杆状DNA病毒属(Badnavirus)的通用检测引物BadnaFP/BadnaRP,从7份芋样品中扩增到Badnavirus病毒的RT/RNase H基因保守区域,获得12个克隆序列,长度为576 bp。序列分析结果显示,来自不同样品的克隆间核苷酸和氨基酸序列相似性分别为78.8%~99.5%和81.3%~99.5%;来自同一样品扩增产物的克隆间在序列上也存在较大差异,核苷酸和氨基酸序列相似性分别为89.6%~100%和92.7%~100%。在系统进化树中,本研究所获序列与Badnavirus病毒的亲缘关系相对较近,聚在同一簇,表明此病毒为Badnavirus属病毒,但与芋杆状病毒(Taro bacilliform virus,TaBV)序列相似性较低,核苷酸和氨基酸相似性分别为58.0%~62.2%和58.5%~64.1%,推测为杆状DNA病毒属的一个新种。根据所测定序列设计了用于该病毒检测的引物P197/P433,对51份芋样品检测结果表明,该引物可有效检测来源于我国芋的Badnavirus病毒。