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云南猕猴mtDNA控制区全序列测定



编号 zgly0000770252

文献类型 期刊论文

文献题名 云南猕猴mtDNA控制区全序列测定

学科分类 220.35;野生动物保护与管理

作者 禹文海  黄芬  杨凤梅  鲁帅尧  赵远  沈冬  王俊斌  陈丽雄  和占龙 

作者单位 中国医学科学院北京协和医学院医学生物学研究所  昆明理工大学生命科学与技术学院 

母体文献 中国比较医学杂志 

年卷期 2011,21(12)

页码 42-45

年份 2011 

分类号 R33 

关键词 猕猴  线粒体DNA  控制区  全序列 

文摘内容 目的测定云南猕猴线粒体DNA控制区全序列, 对其进行鉴定及进化分析。方法利用PCR技术扩增猕猴线粒体DNA控制区全序列, 结合GenBank中下载的猕猴参考序列(AY612638), 采用多个生物学软件对序列碱基组成、同源性、转换/颠换比等遗传信息进行分析, 并基于邻接法(NJ)和最小进化法(ME)构建系统进化树。结果云南猕猴线粒体DNA控制区全长为(1084-1089)bp, A、T、G和c四种碱基平均含量分别为29.9%、26.9%、12.3%和30.9%, A+T含量(56.8%)高于G+C含量(43.2%)。所分析序列间的同源性为91.5%-99.5%, 平均核苷酸变异率为4.5%, 变异类型包括转换、颠换、插入和缺失4种形式, 转换/颠换比值平均为26.1。进化树显示云南猕猴存在两个平行进化的姐妹分支。结论本研究获得了云南猕猴mtDNA控制区全序列, 为猕猴进化关系研究及mtDNA控制区功能研究奠定基础。

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