花椒cpSSR标记开发及在种间、种内的通用性分析

编号 zgly0001686320

文献类型 期刊论文

文献题名 花椒cpSSR标记开发及在种间、种内的通用性分析

作者 李思巧  韦伊  刘洪妤  张志东  张野  王丽华  刘玉林 

作者单位 西北农林科技大学林学院  四川省林业科学研究院生物技术与良种研究所 

母体文献 浙江农林大学学报 

年卷期 2019年06期

年份 2019 

分类号 S573.9 

关键词 植物学  花椒  叶绿体基因组  简单序列重复(SSR)  多态性分析 

文摘内容 叶绿体基因组为母系遗传,保守性高,因此叶绿体基因组中的简单序列重复(SSR)标记可在更高分类水平上进行种质资源鉴定和群体遗传结构分析。利用TRF软件和SSR Hunter软件相结合对花椒Zanthoxylum bungeanum叶绿体基因组中的SSR位点进行筛选。结果显示:花椒叶绿体基因组中共有144个SSR位点,位点间的平均分布距离为1 100.00 bp。基于检测软件设置参数,SSR重复类型主要集中在一、三核苷酸重复,二者占SSR位点总数的91.67%。此外,随机设计合成30对SSR引物对10份花椒种质、 5份竹叶花椒Zanthoxylum armatum种质和1份日本花椒Zanthoxylum piperitum种质进行PCR扩增检测,共筛选出10对多态性引物,其中单核苷酸重复位点的多态性高于多核苷酸重复位点。本研究开发的叶绿体SSR标记可有效区分花椒、竹叶花椒和日本花椒,但在花椒种内并未检测出多态性。表明花椒叶绿体基因组的SSR标记可用于花椒属Zanthoxylum不同种间的遗传多样性分析。图2表3参19