非洲菊ESTs—SSR标记的频率和分布特点

编号 zgly0000467840

文献类型 期刊论文

文献题名 非洲菊ESTs—SSR标记的频率和分布特点

学科分类 220.5010;园林植物学

作者 王继华  瞿素萍  唐开学  李成云  陈海如 

作者单位 云南省农业科学院农业部花卉产品质检中心  云南农业大学云南省植物病理重点实验室 

母体文献 园艺学报 

年卷期 2006,33(5)

页码 1140-1140

年份 2006 

分类号 S682.1 

关键词 非洲菊  表达序列标签  微卫星序列  频率  分布 

文摘内容 采用Tandem Repeats Finder4.0软件对来源于Plant genome Network的非洲菊EST序列的微卫星(SSR)进行系统分析。在17559条, 总长8.5Mb的ESTs序列中, 共有6294个以1—6个核苷酸为基序的SSR序列(长度大于15bp, 匹配值大于80%)。其核苷酸总数占整个基因组核苷酸数的1.64%, 平均1.4kPR.1b就分布有一个大于15bp的SSR。